Найчастіше ехоенцефалографія призначається лікарем-невропатологом при підозрі на ураження головного мозку, а також в ургентних ситуаціях, коли ушкодження мозку можуть загрожувати життю пацієнта. Ехо-ЕГ настільки безпечна, що використовується і для обстеження дітей. 
Отримані результати діагностики дозволяють виявити об’ємні ураження тканин мозку:
- вогнища крововиливу при внутрішньочерепних гематомах;
- пухлини, кістозні утворення і чужорідні тіла;
- гнійні скупчення при абсцесі головного мозку.
Крім того, подібне обстеження дозволяє:
- максимально точно виміряти внутрішньочерепний тиск;
- оцінити ступінь гідроцефалії («водянки») головного мозку.